国际机器学习大会(International Conference on Machine Learning,简称ICML ) 是由国际机器学习学会(IMLS)主办的机器学习国际顶级会议 (CCF-A). ICML 2022 包含数百篇论文和许多专门针对图表的研讨会。在本篇推送中,我们将会分享分享 Graph ML 中最热门的研究领域的概述。
Source:https://towardsdatascience.com/graph-machine-learning-icml-2022-252f39865c70
图生成:去噪扩散就是你所需要的
去噪扩散概率模型( DDPM ) 将在 2022 年接管深度学习领域,几乎所有领域都具有惊人的生成质量和比 GAN 和 VAE 更好的理论特性,例如在图像生成(GLIDE、DALL-E 2、Imagen)、视频生成、文本生成(Diffusion-LM),甚至用于强化学习的扩散。从概念上讲,扩散模型逐渐向输入对象添加噪声(直到它是高斯噪声)并学习预测添加的噪声水平,以便我们可以从对象中减去它(去噪)
论文标题:Equivariant Diffusion for Molecule Generation in 3D
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2203.17003.pdf
作者团队:Emiel Hoogeboom, Victor Garcia Satorras, Clement Vignac, Max Welling
论文标题:SPECTRE: Spectral Conditioning Helps to Overcome the Expressivity Limits
of One-shot Graph Generators
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2204.01613.pdf
作者团队:Karolis Martinkus, Andreas Loukas, Nathanael Perraudin, Roger Wattenhofer
论文标题:Score-based Generative Modeling of Graphs via
the System of Stochastic Differential Equations
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2202.02514.pdf
作者团队:Jaehyeong Jo,Seul Lee,Sung Ju Hwang
Graph Transformer
在今年的 ICML 上,有两篇关于改进 Graph Transformers 的论文。
论文标题:Structure-Aware Transformer for Graph Representation Learning
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2202.03036.pdf
作者团队:Dexiong Chen, Leslie O’Bray,Karsten Borgwardt
论文标题:From block-Toeplitz matrices to differential equations on graphs: towards a
general theory for scalable masked Transformers
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2107.07999.pdf
作者团队:Krzysztof Choromanski, Han Lin,Haoxian Chen,Tianyi Zhang,Arijit Sehanobish
图增强:超越边缘丢失
ICML 2022还带来了一些改善 GNN 自我监督能力的工作,这些工作超越了节点/边缘丢失等随机边缘索引扰动。
论文标题:G-Mixup: Graph Data Augmentation for Graph Classification
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2202.07179.pdf
作者团队:Xiaotian Han,Zhimeng Jian,Ninghao Liu,Xia Hu
论文标题:Local Augmentation for Graph Neural Networks
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2109.03856.pdf
作者团队:Songtao Liu, Rex Ying,Hanze Dong,Lanqing Li,Tingyang Xu
论文标题:GraphFM: Improving Large-Scale GNN Training via Feature Momentum
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2206.07161.pdf
作者团队:Haiyang Yu,Limei Wang,Bokun Wang,Meng Liu
算法推理和图算法
论文标题:The CLRS Algorithmic Reasoning Benchmark
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2205.15659.pdf
作者团队:Petar Velickovi ,Adria Puigdom,David Budden,Razvan Pascanu
论文标题:The Algebraic Path Problem for Graph Metrics
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/sanmarti-n22a/sanmarti-n22a.pdf
作者团队:Enrique Fita Sanmart´ın,Sebastian Damrich
知识图推理
知识图推理长期以来一直是 GraphML 方法的游乐场。在今年的 ICML 上,关于这个主题的论文也不少。作为今年的趋势,我们看到了从嵌入方法(TransE、ComplEx、RotatE、HAKE)到 GNN 和逻辑规则(实际上,GNN 也与逻辑规则相关)的显着迁移。
论文标题:Knowledge Base Question Answering by Case-based Reasoning over Subgraphs
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/das22a/das22a.pdf
作者团队:Rajarshi Das,Ameya Godbole ,Ankita Naik
论文标题:Neuro-Symbolic Hierarchical Rule Induction
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/glanois22a/glanois22a.pdf
作者团队:Claire Glanois, Zhaohui Jiang, Xuening Feng
论文标题:Neural-Symbolic Models for Logical Queries on Knowledge Graphs
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/zhu22c/zhu22c.pdf
作者团队:Zhaocheng Zhu,Mikhail Galkin,Zuobai Zhang,Jian Tang
计算生物学:分子连接、蛋白质结合、性质预测
一般来说,comp bio 在 ICML 上的表现非常好。在这里,我们将了解分子连接 、蛋白质结合 、构象异构体生成和分子特性预测的新方法。
分子连接 是设计蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC)药物的关键部分。对我们来说,仅仅是没有生物学背景的 GNN 研究人员,这意味着给定两个分子,我们想要生成一个有效的连接 分子,它将两个片段 分子连接到一个分子中,同时保留原始片段分子的所有特性。
论文标题:3DLinker: An E(3) Equivariant Variational Autoencoder for Molecular Linker Design
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2205.07309.pdf
作者团队:Yinan Huang,Xingang Peng,Jianzhu Ma, Muhan Zhang
论文标题:Molecular Representation Learning via Heterogeneous Motif Graph Neural
Networks
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/yu22a/yu22a.pdf
作者团队:Zhaoning Yu,Hongyang Gao
论文标题:3D Infomax improves GNNs for Molecular Property Prediction
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/stark22a/stark22a.pdf
作者团队:Hannes Stark, Dominique Beaini,Gabriele Corso
理论和表达性 GNN
现在的GNN 社区仍然致力于研究突破 1-WL 表达能力的天花板并保持至少多项式时间复杂度的方法。同时,每当引入新的 GNN 变体时,相应的理论分析通常表明它比 1-WL 更强大,有时还会将其与经典的 k-WL 层次结构进行比较,我们能否找到更有意义的方法来衡量 GNN 的表达能力扩展?
论文标题:SpeqNets: Sparsity-aware Permutation-equivariant Graph Networks
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/morris22a/morris22a.pdf
作者团队:Christopher Morris,Gaurav Rattan,Sandra Kiefer,Siamak Ravanbkash
论文标题:A Theoretical Comparison of Graph Neural Network Extensions
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/papp22a/papp22a.pdf
作者团队:Pal Andr ´,Roger Wattenhofer
论文标题:Going Deeper into Permutation-Sensitive Graph Neural Networks
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/huang22l/huang22l.pdf
作者团队:Zhongyu Huang,Yingheng Wang,Chaozhuo Li,Huiguang He
可解释的 GNN
由于大多数 GNN 模型都是黑盒子,因此解释 GNN 对关键领域应用的预测非常重要。我们总结了ICML 2022在这个方向上两篇优秀的论文
论文标题:Interpretable and Generalizable Graph Learning via Stochastic Attention Mechanism
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/miao22a/miao22a.pdf
作者团队:Siqi Miao,Miaoyuan Liu,Pan Li
论文标题:Efficient Higher-order Subgraph Attribution via Message Passing
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/xiong22a/xiong22a.pdf
作者团队:Ping Xiong,Thomas Schnake,Gregoire Montavon,Klaus-Robert Mulle
有趣的图应用
1.交通预测
论文标题:DSTAGNN: Dynamic Spatial-Temporal Aware Graph Neural Network for
Traffic Flow Forecasting
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/lan22a/lan22a.pdf
作者团队:Shiyong Lan,Yitong Ma,Weikang Huang, Wenwu Wang
2.图排名
论文标题:GNNRank: Learning Global Rankings from Pairwise Comparisons via
Directed Graph Neural Networks
论文链接:https://arxiv.org/pdf/2202.00211.pdf
作者团队:Yixuan He,Quan Gan,David Wipf,Gesine Reinert
3.物理模拟
论文标题:Constraint-based Graph Network Simulator
论文链接:https://proceedings.mlr.press/v162/rubanova22a/rubanova22a.pdf
作者团队:Yulia Rubanova,Alvaro Sanchez-Gonzalez,Tobias Pfaff
Reference
Galkin, M., 2022. Graph Machine Learning @ ICML 2022 . [online] Medium. Available at: https://towardsdatascience.com/graph-machine-learning-icml-2022-252f39865c70#7cf5 [Accessed 31 August 2022]